Circulation | 南模生物助力揭示心梗后心臟纖維化新機制



2024年9月25日,上??萍即髮W張輝、同濟大學唐娟、復旦大學劉琛共同通訊在Circulation(IF=35.5)雜志上在線發(fā)表了題為“Activation of Imprinted Gene PW1 Promotes Cardiac Fibrosis After Ischemic Injury”的研究論文。該研究表明印跡基因PW1的激活促進缺血性損傷后心臟纖維化。

南模生物為該研究提供了Pw1CreER-2A-eGFP,PDGFRa-CreER小鼠。



印記基因是一類特殊的基因,它們僅表達來自父母一方的等位基因,而另一方的等位基因則不表達。這種表達模式的調(diào)控機制主要包括DNA甲基化、組蛋白修飾以及長鏈非編碼RNA的作用等。近年來的研究表明,印記基因在多種生物學過程中發(fā)揮著重要作用,尤其是在胚胎心臟發(fā)育和先天性心臟病的發(fā)生中扮演著關(guān)鍵角色。盡管如此,關(guān)于印記基因是否參與成年心臟損傷后的再生和修復過程,目前的研究還相對較少。


心臟纖維化以心肌細胞外基質(zhì)(ECM)沉積過多為特征,是心臟病治療的重要目標。PW1(父系表達基因3)是一個由父系等位基因表達的印跡基因,從頭嘌呤生物合成(DNPB)是核苷酸合成的重要途徑。然而,PW1和DNPB在心肌缺血時心肌成纖維細胞產(chǎn)生ECM中的作用尚不清楚。



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在正常成年小鼠中,Pw1只有父本等位基因表達

為評估Pw1的父本和母本等位基因的表達情況,作者構(gòu)建了Pw1CreER-2A-eGFPPw1CreER)小鼠。并通過將雄性雜合子Pw1CreER/+小鼠與雌性Rosa26-loxp-stop-loxp-tdTomato(R26-tdTomato)報告小鼠交配獲得Pw1pCreER/m+;R26-tdTomato小鼠。雌性雜合子Pw1CreER/+小鼠與雄性R26-tdTomato報告小鼠雜交獲得Pw1p+/mCreER;R26-tdTomato小鼠。結(jié)果表明,在Pw1pCreER/m+; R26-tdTomato小鼠的腸道、骨骼肌、胃、肺和心臟中觀察到強的tdTomato信號,并且發(fā)現(xiàn)在心房中tdTomato表達水平高,而心室中表達水平較低。相比之下,在Pw1p+/mCreER;R26-tdTomato小鼠的器官中未檢測到tdTomato信號。以上結(jié)果提示,Pw1只有父本等位基因在正常成年小鼠心臟中是活躍的。

Fig1. Pw1父本等位基因在正常成年小鼠心臟中活躍。

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心肌梗死后梗死區(qū)Pw1印跡缺失

接下來,作者探究了在通過結(jié)扎左前降支(LAD)冠狀動脈誘導的心肌梗死(myocardial?

Infarction,MI)心臟中Pw1等位基因的表達。結(jié)果表明,與假手術(shù)心臟的心室相比,梗死區(qū)域出現(xiàn)了大量eGFP+細胞,表明父本Pw1等位基因在損傷部位被激活。免疫染色顯示eGFP主要在梗死區(qū)域的PDGFRa+成纖維細胞中表達。接下來,作者檢測了Pw1p+/mCreER小鼠MI后的母本等位基因Pw1。結(jié)果顯示,母本Pw1等位基因也在梗死區(qū)域的PDGFRa+成纖維細胞中被激活。這些結(jié)果表明,在MI后梗死區(qū)域兩個Pw1等位基因都被激活。此外,qPCR結(jié)果顯示,梗死區(qū)域父系和母系兩個Pw1等位基因的mRNA水平均顯著高于遠端區(qū)域。

Fig2. 心肌梗死后梗死區(qū)Pw1印跡缺失。

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Pw1失活減少MI后心臟纖維化

鑒于Pw1在損傷區(qū)域的表達上調(diào),作者接下來探究了Pw1在MI后心臟修復中的功能。首先,作者評估了Pw1p+/m+(野生型)、Pw1p+/mCreER(母本失活)、Pw1pCreER/m+(父本失活)和Pw1pCreER/mCreER(Pw1 KO)小鼠在損傷前和損傷后的心臟功能。結(jié)果表明,與對照組相比,MI后28天,Pw1pCreER/m+Pw1 KO小鼠心臟功能(射血分數(shù)、縮短分數(shù)、收縮末期容積、舒張末期容積、左心室收縮末期維度和舒張末期維度)有所改善;而在Pw1p+/mCreER小鼠中未觀察到改善現(xiàn)象。以上結(jié)果表明父本等位基因在MI后心臟功能中的具有主要作用。


隨后對心臟進行天狼星紅染色分析。結(jié)果表明,與WT對照相比,Pw1pCreER/m+Pw1 KO小鼠的替代和間質(zhì)纖維化區(qū)域更小,而血管周圍纖維化區(qū)域沒有顯著差異。對左心室中幾種ECM基因的表達水平進行分析,結(jié)果顯示,Col1a1、Col1a2、Col3a1、Col4a1、Col6a1Fn1的表達水平在Pw1 KO小鼠中下調(diào);編碼肌成纖維細胞標記物Acta2Pw1 KO組中也較低。且Pw1 KO小鼠損傷的左心室中FN1蛋白表達水平降低。這些結(jié)果提示,Pw1缺失可增強心肌梗死后的心臟功能,降低心肌纖維化程度。

Fig3. Pw1缺失可改善心肌梗死后的心肌功能并限制心肌纖維化。

PDGFRa是成年小鼠心臟中成纖維細胞的標志物。作者將Pw1fl/flPdgfra-Cre小鼠交配,獲得了成纖維細胞特異性敲除Pw1Pdgfra-Cre;Pw1fl/fl)的小鼠。與對照組相比,MI后Pw1 CKO小鼠的射血分數(shù)、縮短分數(shù)、收縮末期容積和舒張末期容積相較于對照組有所改善,替代性和間質(zhì)性纖維化區(qū)域更小。Pw1 CKO小鼠損傷心臟組織中ECM基因、Acta2基因的mRNA水平及FN1蛋白表達水平均顯著降低。以上結(jié)果表明Pw1在PDGFRa+細胞中的缺失改善了小鼠MI后的心臟功能并減少了纖維化。


接下來作者探究了Pw1對成纖維細胞ECM基因調(diào)節(jié)作用。通過RNA-seq富集到了細胞組分ECM中富集182個DEGs(Pw1?CKO組下調(diào)135個,上調(diào)47個),表明成纖維細胞中大多數(shù)ECM DEGs表達水平因Pw1缺失而降低。通過RNA-seq分析,找到了在Pw1 CKO成纖維細胞中找到了10640個差異表達基因(DEGs),其中5329個上調(diào),5311個下調(diào)。進一步GO分析結(jié)果表明,在ECM中富集了182個DEGs(與對照組相比,Pw1 CKO組中135個下調(diào),47個上調(diào))。以上結(jié)果表明,Pw1的缺失抑制了MI后心臟成纖維細胞中許多ECM基因的表達。

Fig4. 成纖維細胞中Pw1的失活降低了心肌梗死后許多ECM 基因表達。

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PW1通過轉(zhuǎn)錄激活DNPB因子Pfas來指導ECM的產(chǎn)生

作者接著探究了Pw1的靶基因。通過一系列的高通量測序及實驗驗證,結(jié)果表明,Pfas(編碼DNPB酶PFAS)是損傷后心臟中PW1的直接靶標。


為進一步證明Pfas是否是Pw1在成纖維細胞中調(diào)節(jié)ECM基因所必需的,作者將Pdgfra-CreER小鼠(由南模生物提供)Pfasfl/fl交配獲得了Pfas CKO(PDGFRa-CreER;Pfasfl/fl)及對照(PDGFRa-CreER;Pfasfl/+)小鼠。qPCR結(jié)果表明,Pfas CKO成纖維細胞中Pfas顯著缺失,同時幾個ECM基因減少。上述結(jié)果提示Pw1通過在損傷后心肌成纖維細胞中調(diào)節(jié)Pfas來調(diào)控ECM基因表達。


Fig5. PW1通過調(diào)節(jié)Pfas的表達來調(diào)控ECM基因的表達。

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PW1促進激活的心臟成纖維細胞中的嘌呤合成

由于Pfas編碼DNPB途徑中的酶PFAS,作者假設PW1可能調(diào)節(jié)心臟成纖維細胞中的嘌呤合成,接下來對此進行了驗證。作者對過表達Pw1和野生型的心臟成纖維細胞進行代謝組學分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在Pw1過表達組中,參與嘌呤代謝途徑的代謝物,包括IMP、AMP、肌苷和腺嘌呤表達上調(diào),而在嘧啶代謝途徑中,僅有尿嘧啶表達上調(diào)。此外過表達Pw1的活化成纖維細胞中的AMP濃度顯著升高。這些結(jié)果表明,PW1增強了激活的心臟成纖維細胞中的嘌呤合成。

Fig6. PW1促進活化的心臟成纖維細胞中嘌呤的生物合成。

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DNPB對于激活的成纖維細胞中ECM產(chǎn)生是必需的

Pfas對于Pw1介導的ECM產(chǎn)生至關(guān)重要,并且其過表達增加了激活的心臟成纖維細胞中ECM基因和Acta2的表達。因此,作者假設DNPB途徑可能對于這些細胞中ECM的產(chǎn)生至關(guān)重要。為驗證這一假設,作者利用兩種DNPB抑制劑處理細胞(6-巰基嘌呤和LSN3213128)。結(jié)果表明,幾個ECM基因的表達水平降低,即DNPB途徑對于激活的成纖維細胞中ECM基因的表達是必需的。

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成纖維細胞中Pfas的缺失會限制心臟纖維化,改善心臟功能

最后,作者評估了Pfas在體內(nèi)成纖維細胞中的作用。作者在Pfas CKO小鼠中通過通過永久結(jié)扎左前降支(LAD)冠狀動脈誘導MI。心肌梗死后28天的超聲心動圖評估顯示Pfas CKO小鼠的心功能指標得到了改善,且替代區(qū)和間質(zhì)纖維化區(qū)都較小。

與前述一致,作者進行了RNA-seq分析,結(jié)果表明Pfas的缺失顯著影響了心肌梗死后心肌成纖維細胞中纖維化相關(guān)基因的表達水平。

Fig7. 成纖維細胞中Pfas的失活可改善心肌梗死后的心臟功能并限制心肌纖維化.


總的來說,該研究發(fā)現(xiàn)心肌缺血降低了Pw1基因印跡的DNA甲基化,導致梗死區(qū)域內(nèi)成纖維細胞中兩個Pw1等位基因都激活,而正常成年小鼠中只有父本等位基因活躍。缺失Pw1可減輕心肌纖維化,改善損傷后心功能。從機制上講,PW1通過調(diào)節(jié)DNPB通路酶--磷酸核糖基甲?;拾彼岷铣擅福?em style="box-sizing: border-box;">Pfas)的表達來調(diào)控ECM的產(chǎn)生。DNPB通路對活化成纖維細胞中各種纖維化相關(guān)基因的表達至關(guān)重要。Pfas的缺失顯著減少了心肌纖維化,增強了損傷后的心功能。這些發(fā)現(xiàn)豐富了對心梗后心臟纖維化機制的理解,為臨床治療缺血性心臟病提供了潛在的靶點。






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