遇見科學(xué)家 | 周斌講座回顧:如何建立鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)


體內(nèi)細(xì)胞相互作用過程呈現(xiàn)高度動態(tài),傳統(tǒng)方法難以精確捕獲。近30年來,研究者們利用傳統(tǒng)的遺傳示蹤、組織特異性基因敲除或過表達(dá)等技術(shù),僅能對特定細(xì)胞自身進(jìn)行細(xì)胞或分子水平的操作;而如何實(shí)現(xiàn)對細(xì)胞間相互作用的描繪,依然是科研界面臨的一個巨大挑戰(zhàn)。目前,亟待建立一種新的遺傳操作技術(shù),實(shí)現(xiàn)體內(nèi)監(jiān)測、記錄細(xì)胞之間相互作用,進(jìn)而為細(xì)胞生物學(xué)、遺傳學(xué)及再生醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的發(fā)展提供新的強(qiáng)有力工具。


北京時間12月8日南模生物《遇見科學(xué)家》欄目,非常榮幸邀請到中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心周斌研究員分享一周前他在國際學(xué)術(shù)期刊Science主刊(IF:63.714)發(fā)表的最新成果”Monitoring of cell-cell communication and contact history in mammals”。

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本次學(xué)術(shù)報(bào)告周斌研究員主要給大家講解他是如何建立鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù),及利用該技術(shù)如何巧妙地解決多個領(lǐng)域內(nèi)的重要科學(xué)問題。下面讓我們回顧一下報(bào)告內(nèi)容:

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周斌講解了各類鄰近細(xì)胞互作的原理以及研究的必要性,并以胚胎發(fā)育過程中產(chǎn)生Notch信號通路的心肌細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞為例,證明鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)可以在體內(nèi)將細(xì)胞接觸信息轉(zhuǎn)變?yōu)檫z傳信號。

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研究當(dāng)中他將心肌細(xì)胞作為synNotch信號發(fā)送細(xì)胞,內(nèi)皮細(xì)胞作為synNotch信號接收細(xì)胞,分別構(gòu)建了心肌細(xì)胞特異性表達(dá)synNotch配體的工具小鼠Tnnt2-mGFP,以及內(nèi)皮細(xì)胞特異表達(dá)synNotch受體的工具小鼠Cdh5-αGFP-N-tTA(Cdh5-GFP nanobody-Notch transmembrane domain-tTA)。在Tnnt2-mGFP;Cdh5-αGFP-N-tTA;tetO-nLacZ小鼠中,當(dāng)未發(fā)生細(xì)胞接觸時,synNotch受體的酶切位點(diǎn)被隱藏在特定蛋白區(qū)域內(nèi);當(dāng)細(xì)胞相互接觸時,心肌細(xì)胞膜表面的GFP蛋白和內(nèi)皮細(xì)胞膜表面的GFP抗體特異性結(jié)合,激活synNotch信號通路,受體胞內(nèi)段的tTA進(jìn)入內(nèi)皮細(xì)胞的細(xì)胞核中并結(jié)合tetO轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列,激活報(bào)告基因nLacZ的表達(dá),顯示出與心肌細(xì)胞接觸的內(nèi)皮細(xì)胞,驗(yàn)證了該技術(shù)的可行性。

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但值得注意的是,當(dāng)細(xì)胞分開后,synNotch停止激活,細(xì)胞膜上的tTA將不再入核;同時,由于蛋白代謝,游離的tTA以及報(bào)告蛋白會逐漸減少,受體細(xì)胞將很快失去報(bào)告蛋白標(biāo)記。

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周斌接著講道為了實(shí)現(xiàn)體內(nèi)鄰近細(xì)胞的永久追蹤,他引入了Cre-loxP同源重組系統(tǒng)。當(dāng)Cre-loxP發(fā)生同源重組后,兩個loxP之間的終止序列被切除,報(bào)告基因可以永久性地表達(dá)。在synNotch技術(shù)中引入tetO-Cre;R26-tdT,實(shí)現(xiàn)了永久記錄細(xì)胞之間的相互作用。與tetO-nLacZ和tetO-tdT類似,tetO-Cre工具小鼠受到tTA的調(diào)控,表達(dá)出Cre重組酶。受體和配體細(xì)胞相互接觸后激活synNotch信號通路,誘導(dǎo)受體細(xì)胞表達(dá)Cre,從而使受體細(xì)胞被永久示蹤,該技術(shù)稱作鄰近細(xì)胞遺傳示蹤技術(shù)。

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由于細(xì)胞間的相互作用還與各種疾病發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。周斌講道,他們利用新開發(fā)的鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù)研究了腫瘤細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞之間的相互作用。將過表達(dá)mGFP的TC-1腫瘤細(xì)胞系皮下移植到受體小鼠Cdh5-αGFP-N-tTA;tetO-Cre;R26-tdT中,觀察到幾乎全部的腫瘤血管內(nèi)皮細(xì)胞都被標(biāo)記上tdTomato,并通過長時程追蹤發(fā)現(xiàn),腫瘤血管內(nèi)皮細(xì)胞會遷移到腫瘤外包膜,這部分腫瘤的血管內(nèi)皮細(xì)胞仍然具有典型的轉(zhuǎn)移和浸潤、促血管生成以及炎癥反應(yīng)等特征,為腫瘤的研究治療提供了一定的理論基礎(chǔ)。

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為了拓展鄰近細(xì)胞遺傳學(xué)的應(yīng)用范圍,周斌總結(jié)道,他們構(gòu)建了由Cre重組酶誘導(dǎo)表達(dá)synNotch配體的小鼠R26-mGFP。搭配特定細(xì)胞類型的Cre小鼠品系,可以特異性地使該類型細(xì)胞表達(dá)mGFP,成為配體細(xì)胞。同時,也構(gòu)建了由Cre誘導(dǎo)表達(dá)synNotch受體的小鼠H11-αGFP-N-tTA,結(jié)合Cre小鼠使特定類型細(xì)胞表達(dá)αGFP-N-tTA,成為受體細(xì)胞。


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圖:(i)小鼠胚胎中心肌細(xì)胞表達(dá)synNotch配體(綠色),內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)synNotch受體(紫色)。(ii-iv)新生小鼠心臟中,表達(dá)synNocth配體的心肌細(xì)胞(綠色,ii),利用鄰近細(xì)胞遺傳標(biāo)記技術(shù)捕捉實(shí)時接觸心肌細(xì)胞的內(nèi)皮細(xì)胞(藍(lán)色,iii),利用鄰近細(xì)胞遺傳示蹤技術(shù)追蹤接觸過心肌細(xì)胞的內(nèi)皮細(xì)胞(紅色,iv)。

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最后,周斌感謝南模生物為該研究提供的所有工具小鼠,包括Tnnt2-mGFP, Alb-mGFP, Cdh5-aGFP-N-tTA, R26-mGFP, Pdgfra-aGFP-N-tTA, H11-aGFP-N-tTA, tetO-Dre-BFP 和 Tigre-synNotch?小鼠等。

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課程結(jié)束后,參與直播的老師和同學(xué)們也向周斌研究員提出了自身學(xué)習(xí)和實(shí)驗(yàn)上遇到的問題,并和他進(jìn)行了深入探討,紛紛表示收獲頗豐。

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錯過直播的同學(xué)老師,可以點(diǎn)擊以下路徑觀看講座回放:

https://www.bilibili.com/video/BV1tV4y1P7fv/?spm_id_from=333.999.0.0


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