Eddi免費幫你設(shè)計小鼠敲除方案


小鼠模型定制方案需要考慮很多因素:

定制的目的是什么、該基因敲除是否致死、該基因敲除是否不育、哪個是主要轉(zhuǎn)錄本、敲除哪個區(qū)域效果最好、敲除是否會影響其他基因等等。因此小鼠模型定制方案通常需要交給非常熟練的方案設(shè)計專家分析和制作。

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?不想找技術(shù)人員?

?想自己設(shè)計定制方案?

?想更快速地獲得定制方案?

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OK,沒問題,smarteddi來幫你!

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南模生物已建立超4000種基因修飾小鼠模型,累計了大量可靠的案例,在此基礎(chǔ)上采用國際領(lǐng)先基因編輯算法開發(fā)出一套智能分析系統(tǒng):SmartEddi。

SmartEddi系統(tǒng)采用人工智能算法,通過分析基因結(jié)構(gòu)和信息,給出1-3個定制方案以供選擇。使用 SmartEddi? 時,只需要輸入該基因的完整名稱即可快速獲得該基因的敲除以及條件性敲除的定制方案。更重要的是,SmartEddi系統(tǒng)免費開放給科研工作者,你也可以自己設(shè)計方案,快來和我們一起試試吧!

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Step1: SmartEddi 入口

網(wǎng)頁版:

打開官網(wǎng)網(wǎng)頁http://www.154v3.cn/,點擊“訪問SmartEddi”按鈕進入搜索頁面

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手機版:

關(guān)注南模生物公眾號,點擊下方“一鍵定制方案” 進入搜索頁面

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Step2:輸入您的目的基因、敲除類型和技術(shù)即可獲得報告

根據(jù)您的實驗需要,選擇敲除類型和技術(shù)(【小鼠大學(xué)問】定制策略CRIPSR和ES,如何選擇?),然后輸入目的基因進行搜索。

如果敲除類型您還不確定,建議先打開KO方案,參考方案內(nèi) “已有模型報導(dǎo)” 部分的表型描述,若有報導(dǎo)該基因敲除純合會胚胎致死或新生致死,那么后續(xù)很難獲得KO純合小鼠,因此是建議做條件性敲除。

圖片3-3.png?

為了更準(zhǔn)確獲得定制方案,輸入的基因名稱建議使用NCBI的基因ID,因為有很多基因曾用名是重疊的,而基因ID是唯一的,。

圖片4-4.png?

友情提醒:某些基因和其他基因重疊,需要研究者根據(jù)自己研究進行取舍,?


Step3:選擇最優(yōu)方案

SmartEddi系統(tǒng)給出1-3個定制方案以供選擇,方案一是默認(rèn)的最佳方案,但是也可以根據(jù)實驗需要選擇最適合自己的方案,然后點擊右方的下載按鈕即可下載。

關(guān)于方案選擇,有以下建議:方案最核心的地方是敲除區(qū)域,敲除區(qū)域通常是會選擇導(dǎo)致移碼突變的 exon,或者選擇編碼重要結(jié)構(gòu)域的 exon,從而實現(xiàn)蛋白突變或缺失。選擇方案時需根據(jù)基因的具體結(jié)構(gòu),選擇最佳方案。

圖片5-5.png


怎么樣?是不是很簡單,快來試試吧!

點擊這里進入SmartEddi系統(tǒng),一鍵定制屬于你的方案!


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