Nature Genetics | 南模生物助力揭示心內(nèi)膜起源的成纖維細(xì)胞調(diào)控心臟纖維化


心力衰竭每年都會(huì)導(dǎo)致全球范圍內(nèi)大量的個(gè)體致病或死亡。在心臟損傷早期,心臟成纖維細(xì)胞被激活并分化成具有收縮性的肌成纖維細(xì)胞,產(chǎn)生大量的胞外基質(zhì),生成富含膠原的疤痕,修補(bǔ)由于心肌死亡導(dǎo)致的心臟缺損,維持心臟基本功能。然而,成纖維細(xì)胞增殖過多會(huì)導(dǎo)致胞外基質(zhì)的過度積累并導(dǎo)致心臟彈性減弱,降低心室壁的順應(yīng)性,從而嚴(yán)重影響心臟功能,最終促使心力衰竭。因此,了解驅(qū)動(dòng)心臟纖維化病理過程的基本機(jī)制,對(duì)于把控成纖維細(xì)胞在心臟損傷后的適度增殖,更大程度地發(fā)揮成纖維細(xì)胞保護(hù)心臟功能的作用至關(guān)重要,并為開發(fā)治療心臟纖維化的潛在靶標(biāo)提供新的思路和見解,對(duì)緩解心臟衰竭、提高患者生存質(zhì)量具有臨床指導(dǎo)意義。


2023年3月23日,中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所)周斌研究組在Nature Genetics上發(fā)表了題為 “Dual genetic tracing reveals a unique fibroblast subpopulation modulating cardiac fibrosis?的研究論文。周斌研究組開發(fā)了雙同源重組酶介導(dǎo)的遺傳譜系示蹤系統(tǒng)來特異性追蹤心內(nèi)膜起源的成纖維細(xì)胞(Endocardium-derived fibroblast,?EndoFb,揭示了EndoFb是調(diào)節(jié)心臟纖維化的獨(dú)特成纖維細(xì)胞亞群。利用EndoFb-tracer系統(tǒng),研究人員發(fā)現(xiàn)在心臟發(fā)育和成體穩(wěn)態(tài)情況下EndoFb具有非常明顯的區(qū)域性分布特征,在心臟壓力負(fù)荷下(TAC模型),EndoFb比其他成纖維細(xì)胞亞群更具增殖潛能。通過Fb-ProTracer系統(tǒng),研究人員實(shí)現(xiàn)了不依賴于預(yù)先標(biāo)記成纖維細(xì)胞亞群、無偏好地評(píng)估成纖維細(xì)胞在穩(wěn)態(tài)或損傷后的增殖情況,揭示了TAC后成纖維細(xì)胞的增殖區(qū)域性。利用EndoFb-DTR系統(tǒng),研究人員在遺傳學(xué)水平上特異性清除EndoFb,發(fā)現(xiàn)EndoFb清除后可顯著緩解TAC引起的心臟纖維化并減緩了心臟衰竭的進(jìn)程,證實(shí)了EndoFb調(diào)控心臟纖維化和病理性心肌重塑。通過構(gòu)建成纖維細(xì)胞亞群特異性基因敲除Ctnnb1-KO系統(tǒng),揭示W(wǎng)nt信號(hào)通路是TAC后調(diào)控EndoFb擴(kuò)張的重要分子機(jī)制。


南模生物為該研究構(gòu)建了多種基因修飾小鼠:R26-LSL-RSR-tdT-DTR, Tnnt2-Dre-Cre-tdTomato, Npr3-tTA以及Col1a2-RSR-CreER等。

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之前的研究主要用單同源重組酶介導(dǎo)的譜系示蹤方法,通過心內(nèi)膜的遺傳工具小鼠和心外膜的遺傳工具小鼠去研究心內(nèi)膜衍生的成纖維細(xì)胞和心外膜衍生的成纖維細(xì)胞。然而,傳統(tǒng)的遺傳譜系示蹤方法雖然能夠示蹤到不同的成纖維細(xì)胞亞群,但是由于心內(nèi)膜細(xì)胞和心外膜細(xì)胞還會(huì)貢獻(xiàn)給許多其他細(xì)胞類型,包括血管內(nèi)皮細(xì)胞、周細(xì)胞、平滑肌細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等,這些細(xì)胞類型的存在不僅會(huì)干擾研究人員對(duì)成纖維細(xì)胞在穩(wěn)態(tài)和損傷情況下的表型探究,也無法僅對(duì)成纖維細(xì)胞進(jìn)行特異性的遺傳操作,這就使得探究不同成纖維細(xì)胞亞群對(duì)心臟纖維化和心力衰竭影響的潛在機(jī)制成為一個(gè)難題。


本研究中,研究人員首先構(gòu)建了高效穩(wěn)定的特異性追蹤心內(nèi)膜來源的成纖維細(xì)胞亞群的遺傳學(xué)模型,為探究EndoFb在心臟纖維化過程中的細(xì)胞及分子機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。研究人員將心內(nèi)膜的工具小鼠Nfatc1-Dre,成纖維細(xì)胞的工具小鼠Col1a2-CreER,與雙系統(tǒng)報(bào)告基因小鼠R26-RL-GFP交配,產(chǎn)生Nfatc1-Dre;Col1a2-CreER;R26-RL-GFP(EndoFb-tracer)小鼠。在該系統(tǒng)中,Dre-rox重組去除第一個(gè)Stop,隨后的Cre-loxP重組在他莫西芬(Tam)誘導(dǎo)下去除第二個(gè)Stop,實(shí)現(xiàn)了用GFP報(bào)告基因永久遺傳標(biāo)記EndoFb。在發(fā)育的心臟中對(duì)EndoFb-tracer小鼠進(jìn)行Tam注射,研究人員發(fā)現(xiàn)GFP+的EndoFb主要分布在室間隔的上半部分和左心室的小梁心肌層,較少分布于右心室以及左心室的致密心肌層。為了在成體損傷情況下高效標(biāo)記EndoFb和其他成纖維細(xì)胞亞群,研究人員在EndoFb-tracer系統(tǒng)中引入R26-LSL-tdTomato報(bào)告基因小鼠,在Nfatc1-Dre;Col1a2-CreER;R26-RL-GFP;R26-LSL-tdTomato四基因小鼠中,EndoFb被標(biāo)記成GFP+tdTomato+,其他來源的成纖維細(xì)胞(主要是EpiFb)被標(biāo)記為GFP–tdTomato+。通過流式細(xì)胞術(shù)和EdU摻入實(shí)驗(yàn),研究人員發(fā)現(xiàn),TAC損傷后EndoFb的擴(kuò)增潛能明顯高于其他來源的成纖維細(xì)胞,且在纖維化區(qū)域高度富集。


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圖1. 利用雙重組酶特異性標(biāo)記EndoFb并發(fā)現(xiàn)其在心臟壓力負(fù)荷后顯著擴(kuò)增


為了在心臟損傷后無偏好地評(píng)估成纖維細(xì)胞的增殖情況,研究人員在最近報(bào)道的體內(nèi)細(xì)胞增殖示蹤技術(shù)ProTracer的基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)了成纖維細(xì)胞特異的Fb-ProTracer系統(tǒng)。利用Col1a2-CreER這個(gè)成纖維細(xì)胞工具小鼠,結(jié)合Ki67-LSL-2A-Dre,以及雙系統(tǒng)報(bào)告基因小鼠R26-RL-GFP,獲得Col1a2-CreER;Ki67-LSL-2A-Dre;R26-RL-GFP(Fb-ProTracer)小鼠。在該系統(tǒng)中,Tam會(huì)誘導(dǎo)Col1a2-CreER中的CreER入核以去除Ki67-LSL-2A-Dre中的Stop序列,產(chǎn)生一個(gè)新的Ki67-2A-Dre等位基因;并去除R26-RL-GFP等位基因的第一個(gè)Stop序列,注射Tam后,Ki67-2A-Dre將切除增殖的成纖維細(xì)胞中的第二個(gè)Stop序列,并開始連續(xù)記錄增殖的成纖維細(xì)胞。對(duì)TAC后的Fb-ProTracer小鼠進(jìn)行分析,研究人員發(fā)現(xiàn)GFP+的成纖維細(xì)胞主要集中在室間隔和左心室的上半部分,該表型與EndoFb在TAC損傷后的區(qū)域性擴(kuò)張高度一致,進(jìn)一步提示EndoFb在TAC損傷后增殖的活躍性以及EndFb在該損傷模型下對(duì)纖維化的重要貢獻(xiàn)。


為了探究TAC損傷后EndoFb對(duì)心臟纖維化的在體功能,研究人員構(gòu)建了Nfatc1-Dre;Col1a2-CreER;R26-LSL-RSR-tdT-DTR(EndoFb-DTR)小鼠,在該系統(tǒng)中,Dre-rox和Cre-loxP重組同時(shí)介導(dǎo)了tdTomato和白喉毒素受體(DTR)在EndoFb中的專一性表達(dá)。對(duì)EndoFb-DTR小鼠進(jìn)行Tam注射,可將EndoFb標(biāo)記成紅色,對(duì)EndoFb-DTR小鼠進(jìn)行DT處理,又可實(shí)現(xiàn)對(duì)tdTomato+的EndoFb遺傳性清除。在TAC后第8天對(duì)EndoFb-DTR小鼠進(jìn)行DT注射以清除EndoFb,在TAC后第28天收集EndoFb-DTR小鼠心臟進(jìn)行組織學(xué)分析,結(jié)果表明,與PBS處理的對(duì)照組相比,DT處理組的小鼠心臟纖維化程度減弱,心臟肥大水平下降,心肌細(xì)胞大小更接近野生型小鼠。對(duì)PBS處理組小鼠和DT處理組小鼠進(jìn)行心臟功能連續(xù)監(jiān)測(cè),統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明,DT處理組小鼠心臟功能下降趨勢(shì)相較于PBS處理組小鼠明顯減緩。綜合以上數(shù)據(jù),研究人員認(rèn)為EndoFb對(duì)TAC后的心臟纖維化具有重要貢獻(xiàn),減少EndoFb在TAC后的數(shù)量將有效保護(hù)心臟功能,減緩心臟衰竭進(jìn)程。


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圖2. EndoFb清除后可以顯著緩解心臟纖維化


鑒于EndoFb在TAC損傷后具有更強(qiáng)的增殖潛能,且在TAC后消除EndoFb在一定程度上減輕了心臟纖維化,為探索調(diào)控EndoFb潛在的分子機(jī)制,研究人員從EndoFb-tracer小鼠的心室中分離出GFP+和GFP–的成纖維細(xì)胞進(jìn)行RNA-seq分析。在假手術(shù)(Sham)組和TAC組的心臟中,跟成纖維細(xì)胞激活有關(guān)的基因,如Thbs4、Cilp、Postn、Comp、Fmod、Cthrc1和Ddah1,在GFP+的成纖維細(xì)胞中表達(dá)均比其在GFP–的成纖維細(xì)胞中的表達(dá)更高?;蚋患治鲲@示,與GFP–的成纖維細(xì)胞相比,GFP+的成纖維細(xì)胞中的Wnt信號(hào)通路和成纖維細(xì)胞增殖通路均受到正向調(diào)節(jié)。基因表達(dá)熱圖表明,與Wnt信號(hào)通路相關(guān)的基因,如Wnt10b、Ccn4、Wnt9a、Fzd4、Fzd7、Sox9、Lzts2和Dkk3,在Sham組和TAC組的GFP+的成纖維細(xì)胞中均被上調(diào)。綜合RNA-seq的數(shù)據(jù),研究人員認(rèn)為,TAC損傷后,EndoFb相較于心臟中其他成纖維細(xì)胞亞群處于一種更活化的狀態(tài),且具有更活躍的增殖信號(hào)通路和Wnt信號(hào)通路基因的活化。


為了在EndoFb中特異性敲除Wnt信號(hào)通路,研究人員構(gòu)建了Nfatc1-Dre;Col1a2-RSR-CreER;Ctnnb1-flox小鼠(Ctnnb1-KO系統(tǒng))。在這種設(shè)計(jì)中,Nfatc1-Dre中的Dre切除掉Col1a2-RSR-CreER中的rox-Stop-rox,將其變成Col1a2-CreER等位基因,CreER在Tam的作用下切除Ctnnb1-flox中的Exon1-4,從而實(shí)現(xiàn)僅在心內(nèi)膜來源的成纖維細(xì)胞中敲除Ctnnb1。為了同時(shí)追蹤EndoFb并敲除EndoFb中的Ctnnb1,研究人員將Ctnnb1-KO系統(tǒng)與R26-RL-GFP交配,獲得Nfatc1-Dre;Col1a2-RSR-CreER;R26-RL-GFP;Ctnnb1-fl小鼠,并將其作為突變體小鼠,同時(shí)將它們的同窩小鼠Nfatc1-Dre;Col1a2-RSR-CreER;R26-RL-GFP;Ctnnb1-wt作為對(duì)照,用于TAC后的分析。對(duì)TAC后28天的對(duì)照組小鼠心臟和突變體小鼠心臟進(jìn)行組織學(xué)分析,結(jié)果表明,與對(duì)照組小鼠相比,突變體小鼠心臟中纖維化程度減輕,心臟肥大水平下降,心肌細(xì)胞大小更接近野生型小鼠。對(duì)照組小鼠和突變體小鼠進(jìn)行心臟功能連續(xù)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示突變體小鼠心臟功能下降趨勢(shì)相較于對(duì)照組小鼠明顯減緩。這些數(shù)據(jù)表明,在EndoFb中特異性敲除Ctnnb1能明顯減少TAC所導(dǎo)致的心臟纖維化,并能保護(hù)心臟功能。
以上研究揭示了先前一直未受重視的起源于心內(nèi)膜的獨(dú)特成纖維細(xì)胞亞群(EndoFb),發(fā)現(xiàn)該亞群的成纖維細(xì)胞在心臟纖維化病理過程中具有重要的調(diào)節(jié)功能,為未來心臟疾病的治療提供了一個(gè)新的潛在靶點(diǎn)。該研究也展示了使用雙重組酶介導(dǎo)的遺傳譜系示蹤技術(shù)對(duì)于研究體內(nèi)某個(gè)細(xì)胞亞群在特定疾病發(fā)展過程中的機(jī)制和功能的優(yōu)勢(shì),為研究亞群細(xì)胞對(duì)多種疾病的發(fā)生發(fā)展提供新的思路。


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圖3. 靶向EndoFb可減緩心臟纖維化和心功能衰竭


文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41588-023-01337-7


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